由于网络的虚拟性、匿名性查找罪犯如同大海捞针。但罪犯完成计算机犯罪却只需要很短的时间，有时只需要几秒钟，并且犯罪后可以很快地将犯罪记录消去，不留痕迹。犯罪证据的获取尤其是电子证据取证及效力，就成为办理网络犯罪的主要难点所在。
1、电子证据的取证
对能够为法庭接受的、足够可靠和有说服性的、存在于计算机、相关外部设备中的电子证据的确认、保护、提取和归档的过程即是电子证据的取证。电子证据获取技术的关键，是如何保证在获取数据的同时不破坏原始介质。在安庆市迎江区人民提起公诉的许某传播淫秽物品案中，犯罪嫌疑人许某利用互联网传播淫秽视频电影，该案认定犯罪事实的证据除了犯罪嫌疑人供述、证人证言、鉴定结论等传统证据外，还包括电子证据：视频电影文件点击率清单、服务器交易记录、机关网监支队远程勘验记录等。
2、电子证据的认定
电子证据能否被法庭认可并作为定案的证据，根据现行法律并无依据。我国的《刑事诉讼法》规定了七种证据，这是法律明文规定的证据的外延，即只有以上的证据才能被采纳为定案的证据。电子证据虽然从其本质来讲和这几类法定证据一样，都能证明案件事实，从内涵上并无不同，但我国法律却没有把电子证据纳入法定证据的范围赋予其明确合法的外衣。这是法律滞后于社会发展的一个明显的表现。
一、关于网络犯罪案件的管辖
1、网络犯罪案件由犯罪地机关立案侦查。必要时，可以由犯罪嫌疑人居住地机关立案侦查。网络犯罪案件的犯罪地包括用于实施犯罪行为的网站服务器所在地，网络接入地，网站建立者、管理者所在地，被侵害的计算机信息系统或其管理者所在地，犯罪嫌疑人、被害人使用的计算机信息系统所在地，被害人被侵害时所在地，以及被害人财产遭受损失地等。涉及多个环节的网络犯罪案件，犯罪嫌疑人为网络犯罪提供帮助的，其犯罪地或者居住地机关可以立案侦查。
2、有多个犯罪地的网络犯罪案件，由最初受理的机关或者主要犯罪地机关立案侦查。有争议的，按照有利于查清犯罪事实、有利于诉讼的原则，由共同上级机关指定有关机关立案侦查。需要提请批准逮捕、移送审查起诉、提起公诉的，由该机关所在地的人民、人民受理。
3、具有下列情形之一的，有关机关可以在其职责范围内并案侦查，需要提请批准逮捕、移送审查起诉、提起公诉的，由该机关所在地的人民、人民受理：
（1）一人犯数罪的；
（2）共同犯罪的；
（3）共同犯罪的犯罪嫌疑人、被告人还实施其他犯罪的；
（4）多个犯罪嫌疑人、被告人实施的犯罪存在关联，并案处理有利于查明案件事实的。
4、对因网络交易、技术支持、资金支付结算等关系形成多层级链条、跨区域的网络犯罪案件，共同上级机关可以按照有利于查清犯罪事实、有利于诉讼的原则，指定有关机关一并立案侦查，需要提请批准逮捕、移送审查起诉、提起公诉的，由该机关所在地的人民、人民受理。
5、具有特殊情况，由异地机关立案侦查更有利于查清犯罪事实、保证案件公正处理的跨省（自治区、直辖市）重大网络犯罪案件，可以由商最高人民和最高人民指定管辖。
6、人民对于机关移送审查起诉的网络犯罪案件，发现犯罪嫌疑人还有犯罪被其他机关立案侦查的，应当通知移送审查起诉的机关。人民受理案件后，发现被告人还有犯罪被其他机关立案侦查的，可以建议人民补充侦查。人民经审查，认为需要补充侦查的，应当通知移送审查起诉的机关。经人民通知，有关机关根据案件具体情况，可以对犯罪嫌疑人所犯其他犯罪并案侦查。
7、为保证及时结案，避免超期羁押，人民对于机关提请批准逮捕、移送审查起诉的网络犯罪案件，第一审人民对于已经受理的网络犯罪案件，经审查发现没有管辖权的，可以依法报请共同上级人民、人民指定管辖。
8、部分犯罪嫌疑人在逃，但不影响对已到案共同犯罪嫌疑人、被告人的犯罪事实认定的网络犯罪案件，可以依法先行追究已到案共同犯罪嫌疑人、被告人的刑事责任。在逃的共同犯罪嫌疑人、被告人归案后，可以由原机关、人民、人民管辖其所涉及的案件。