个体户就员工的工资薪金申报个税的，可以登录电子税务系统，选择公司账户登录。假如是初次登录的，还需要先申请注册；随后选择网上办税，选择申报表，按页面提示进行操作点击，在申报录入的页面中，依次找到录入被投资单位信息、记税信息等，录入完成后，进行申报即可。