双方不能协议离婚的情形包括双方当事人对子女抚养、财产和债务处理等事项没有达成协议、一方为无民事行为能力人或者是民事行为能力人等。双方可以诉讼离婚。
法律依据:
《《婚姻登记条例》》第十二条
办理离婚登记的当事人有下列情形之一的，婚姻登记机关不予受理：
（一）未达成离婚协议的；
（二）属于无民事行为能力人或者民事行为能力人的；
（三）其结婚登记不是在中国内地办理的。
《《婚姻登记条例》》第十三条
婚姻登记机关应当对离婚登记当事人出具的证件、证明材料进行审查并询问相关情况。对当事人确属自愿离婚，并已对子女抚养、财产、债务等问题达成一致处理意见的，应当当场予以登记，发给离婚证。