侵占罪机关的处理方式为：进行侦查，如果确实存在犯罪行为，告知被害人向人民起诉。侵占罪是自诉案件，司法管辖机关是人民不是机关。
一、刑事诉讼程序主要有哪些
刑事诉讼的程序主要有以下几个：一、刑事诉讼程序——立案机关或者人民发现犯罪事实或者犯罪嫌疑人，应当按照管辖范围立案侦查。二、刑事诉讼程序——侦查机关对于现行犯或者重大嫌疑分子可以刑事拘留。对于被拘留的人，应当在拘留后的24小时以内进行讯问。犯罪嫌疑人在被侦查机关第一次讯问后或者采取强制措施之日起，可以聘请律师为其提供法律咨询、代理申诉、控告。受委托的律师有权向侦查机关了解犯罪嫌疑人涉嫌的罪名，可以会见在押的犯罪嫌疑人，向犯罪嫌疑人了解有关的案件情况。三、刑事诉讼程序——审查起诉人民审查案件，应当讯问犯罪嫌疑人，听取被害人和犯罪嫌疑人、被害人委托的人的意见。公诉案件自案件移送审查起诉之日起，犯罪嫌疑人有权委托辩护人。自诉案件的被告人有权随时委托辩护人。人民自收到移送审查起诉的案件材料之日起三日以内，应当告知犯罪嫌疑人有权委托辩护人。人民自受理自诉案件之日起三日以内，应当告知被告人有权委托辩护人。辩护律师自人民对案件审查起诉之日起，可以查阅、摘抄、复制本案的诉讼文书、技术性鉴定材料，可以同在押的犯罪嫌疑人会见和通信。人民对于机关移送起诉的案件，应当在一个月以内作出决定，重大、复杂的案件，可以延长半个月。人民认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民提起公诉。四、刑事诉讼程序——审判人民对提起公诉的案件进行审查后，对于起诉书中有明确的指控犯罪事实并且附有证据目录、证人名单和主要证据复印件或者照片的，应当决定开庭审判。除涉及国家秘密或者个人隐私的案件，人民审判第一审案件应当公开进行。
二、刑事自诉的范围包括哪些
刑事诉讼的自诉案件的范围包括：1、被害人自己向人民起诉，人民才处理的案件，包括侵占罪、侮辱、暴力干涉婚姻自由罪； 2、被害人有证据证明的轻微刑事案件，可以包括造成轻伤的故意伤害罪等犯罪； 3、被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而机关或者人民不予追究被告人刑事责任的案件，若仍为应当判处死刑的案件也可以自诉。
三、不立案就不查了吗
不立案不是就不查了。
不够立案应该是说没达到刑事立案的标准，是没有刑事责任了，不会定罪判刑。但是并不意味就不会调查了，如果其行为违反治安管理法，机关可以根据情况给予行政拘留、罚款等行政处罚。立案是指、司法机关及其它行政执法机关对于报案、控告、举报、自首以及自诉人起诉等材料，按照各自的管辖范围进行审查后，认为有犯罪事实发生并需要追究刑事责任时，决定将其作为刑事案件进行侦查或者审判的一种诉讼活动。
在人民、机关、机关立案侦查或者在人民受理案件以后，逃避侦查或者审判的，不受追诉期限的。 被害人在追诉期限内提出控告，人民、人民、机关应当立案而不予立案的，不受追诉期限的。司法机关对于控告、检举或者自首的材料，应按管辖范围进行审查。对于不属于自己管辖的，应移送主管机关处理，并通知控告人、检举人；对于不属于自己管辖而又必须采取紧急措施的，应先采取紧急措施，然后移送主管机关。如符合立案条件的，应当立案。
【本文关联的相关法律依据】
《刑法》第二百七十条
将代为保管的他人财物非法占为己有，数额较大，拒不退还的，处二年以下有期徒刑、拘役或者罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处二年以上五年以下有期徒刑，并处罚金。
将他人的遗忘物或者埋藏物非法占为己有，数额较大，拒不交出的，依照前款的规定处罚。
本条罪，告诉的才处理。