加班费计入员工工资总额，合并计算个人所得税。综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。休息日加班工资=月工资基数÷全年月平均计薪日×200%×加班天数；工作日加班工资=月工资基数÷全年月平均计薪日×150%×加班天数；法定节假日加班工资=月工资基数÷全年月平均计薪日×300%×加班天数。
【法律依据】
《中华人民共和国个人所得税法》第二条
下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。